주요논문
1. [SCIE] Hypoxic microenvironment determines the phenotypic plasticity and spatial distribution of cancer-associated fibroblasts [Clinical and Translational Medicine] - 2023-10-01
2. [SCIE] Intercellular cross-talk through lineage-specific gap junction of cancer-associated fibroblasts related to stromal fibrosis and prognosis [SCIENTIFIC REPORTS] - 2023-08-30
3. [SCIE] Clinicogenomic characteristics and synthetic lethal implications of germline homologous recombination? deficient hepatocellular carcinoma [HEPATOLOGY] - 2023-08-01
4. [SCIE] Whole-genome sequencing reveals an association between small genomic deletions and an increased risk of developing Parkinson's disease [EXPERIMENTAL AND MOLECULAR MEDICINE] - 2023-03-01
5. [SCIE] Reshaping tumor immune microenvironment by Epstein-Barr virus activation in the stroma of colorectal cancer [ISCIENCE] - 2022-12-01
연구실 소개
암유전체 및 생명정보
본 연구실은 bioinformatics를 이용하여 cancer genomics 연구하고 있으며, 유전체 데이터 분석에 많은 비중을 두고 있습니다.
현재 3명의 의과학 대학원생 (석사)과 1명의 의학과 대학원생 (박사), 3명의 연구원이 참여하고 있으며 세부 연구 분야로 targeted next generation sequencing의 분석 기법 개발; 액상 생검 유전체 데이터로 부터 변이 검출의 정밀도 향상을 위한 분석 파이프라인 개발; 간암, 여성암, 대장암 및 오가노이드 유전체 데이터 분석; 정상인 및 질환 환자의 유전체 데이터로 부터 germline 변이 발굴 및 분석; 유전체 데이터의 변이 검출 정밀도 향상을 위한 deep learning 적용; 유전체 데이터로 부터 neo-antigen 발굴; 약물 표적 유전자 발굴을 위해 cas9 처리 유전체 데이터로 부터 표적 유전자 발굴을 위한 분석 기법 개발 및 후보 유전자 발굴 등 유전체 데이터를 이용한 다양한 주제의 연구를 진행하고 있습니다.
교수/연구
