주요논문
1. [SCIE] Intratumoral spatiotemporal heterogeneity of HPV DNA status in HPV-associated oropharyngeal squamous cell carcinoma with clinical record [Journal of Translational Medicine] - 2026-05-18
2. [SCIE] Annotation-free prediction of immunotherapy response in melanoma using single-cell transcriptomic data [PLoS One] - 2026-02-27
3. [SCIE] Proteogenomic profiling predicts outcomes of adjuvant chemotherapy in extrahepatic cholangiocarcinoma [JOURNAL OF HEPATOLOGY] - 2026-01-15
4. [SCIE] Identification of a unique subpopulation of mucosal fibroblasts in colorectal cancer with tumor-restraining characteristics [MOLECULES AND CELLS] - 2025-10-01
5. [SCIE] Whole genome sequencing reveals telomere associated genomic differences between healthy and unhealthy aging in a Korean population [BIOGERONTOLOGY] - 2025-08-22
연구실 소개
암유전체 및 생명정보
본 연구실은 bioinformatics를 이용하여 cancer genomics 연구하고 있으며, 유전체 데이터 분석에 많은 비중을 두고 있습니다.
현재 3명의 의과학 대학원생 (석사)과 1명의 의학과 대학원생 (박사), 3명의 연구원이 참여하고 있으며 세부 연구 분야로 targeted next generation sequencing의 분석 기법 개발; 액상 생검 유전체 데이터로 부터 변이 검출의 정밀도 향상을 위한 분석 파이프라인 개발; 간암, 여성암, 대장암 및 오가노이드 유전체 데이터 분석; 정상인 및 질환 환자의 유전체 데이터로 부터 germline 변이 발굴 및 분석; 유전체 데이터의 변이 검출 정밀도 향상을 위한 deep learning 적용; 유전체 데이터로 부터 neo-antigen 발굴; 약물 표적 유전자 발굴을 위해 cas9 처리 유전체 데이터로 부터 표적 유전자 발굴을 위한 분석 기법 개발 및 후보 유전자 발굴 등 유전체 데이터를 이용한 다양한 주제의 연구를 진행하고 있습니다.
교수/연구
